MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus johnsonii NCC 533

Total Repeats: 5821

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005362	TAA	2	6	1370	1375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_005362	TTA	2	6	1406	1411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_005362	GT	3	6	1423	1428	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_005362	CTA	3	9	1472	1480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_005362	AT	3	6	1496	1501	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_005362	TAAA	2	8	1505	1512	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_005362	AGG	2	6	1534	1539	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_005362	T	7	7	2705	2711	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_005362	A	6	6	2800	2805	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_005362	A	7	7	2839	2845	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_005362	A	6	6	2891	2896	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_005362	AT	3	6	2914	2919	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_005362	AGA	2	6	2941	2946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_005362	A	6	6	8702	8707	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_005362	T	6	6	8716	8721	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_005362	TAA	3	9	8725	8733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_005362	A	6	6	8761	8766	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_005362	T	6	6	8777	8782	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_005362	ATT	2	6	8816	8821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_005362	AGG	2	6	8867	8872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_005362	ATT	2	6	8877	8882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_005362	TAA	2	6	10007	10012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_005362	T	6	6	10045	10050	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_005362	TAT	2	6	10055	10060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_005362	AAG	2	6	10063	10068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_005362	TGCT	2	8	11004	11011	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_005362	GAT	2	6	11019	11024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_005362	AAGC	2	8	11025	11032	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_005362	T	6	6	11034	11039	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_005362	TATAA	2	10	11044	11053	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_005362	TA	3	6	11064	11069	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_005362	TGA	2	6	11074	11079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_005362	AGGA	2	8	11096	11103	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_005362	ATTA	2	8	14994	15001	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_005362	CTATA	2	10	15003	15012	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_005362	AT	3	6	15956	15961	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_005362	TAT	2	6	17186	17191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_005362	TTTTA	2	10	17192	17201	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_005362	A	7	7	17245	17251	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_005362	CTT	2	6	17266	17271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_005362	TTA	2	6	19351	19356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_005362	ATT	2	6	19382	19387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_005362	AAAAT	2	10	19410	19419	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_005362	TAACT	2	10	19425	19434	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_005362	A	6	6	19435	19440	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_005362	A	7	7	19443	19449	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_005362	TAA	2	6	19461	19466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_005362	AT	3	6	19468	19473	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_005362	ATG	2	6	19540	19545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_005362	A	6	6	19586	19591	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_005362	T	7	7	19612	19618	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_005362	A	6	6	21002	21007	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_005362	T	6	6	21061	21066	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_005362	CA	3	6	21080	21085	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_005362	GAG	2	6	21118	21123	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_005362	GAA	2	6	21124	21129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_005362	ATT	2	6	21203	21208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_005362	ATA	2	6	21218	21223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_005362	TAAT	2	8	21242	21249	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_005362	A	6	6	21258	21263	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_005362	ATC	2	6	21281	21286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_005362	ATG	2	6	21352	21357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_005362	T	6	6	21420	21425	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_005362	TAT	2	6	21465	21470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_005362	A	7	7	21489	21495	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_005362	AGAT	2	8	22685	22692	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_005362	TTA	2	6	22699	22704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_005362	TATTT	2	10	23617	23626	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_005362	T	6	6	23633	23638	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_005362	TTCA	2	8	23664	23671	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_005362	GCTAA	2	10	23673	23682	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
72	NC_005362	AGG	2	6	23704	23709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_005362	TAT	2	6	24501	24506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_005362	TTA	2	6	24507	24512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_005362	TAA	2	6	24527	24532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_005362	AT	3	6	25390	25395	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_005362	AT	4	8	25426	25433	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_005362	T	6	6	25439	25444	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_005362	ATG	2	6	25449	25454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_005362	AAAG	2	8	25467	25474	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_005362	A	6	6	25480	25485	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_005362	TAA	2	6	25509	25514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_005362	AAG	2	6	25522	25527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_005362	TTTTTA	2	12	25596	25607	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_005362	ATG	2	6	25616	25621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_005362	GGT	2	6	25627	25632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_005362	AATCA	2	10	27959	27968	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_005362	ACGTT	2	10	28065	28074	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
89	NC_005362	A	6	6	28091	28096	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_005362	ATT	2	6	28111	28116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_005362	TGT	2	6	28119	28124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_005362	TAGG	2	8	28130	28137	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_005362	TTA	2	6	28200	28205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_005362	ATA	2	6	28209	28214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_005362	TC	3	6	28221	28226	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_005362	A	6	6	28251	28256	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_005362	TCC	2	6	29004	29009	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_005362	ATA	2	6	29010	29015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_005362	AT	4	8	29022	29029	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_005362	ATCTT	2	10	29032	29041	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_005362	TAAAAT	2	12	29064	29075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_005362	TAAAT	2	10	29104	29113	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_005362	GAA	2	6	29115	29120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_005362	AT	3	6	30731	30736	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_005362	TTTC	2	8	30745	30752	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_005362	ATA	2	6	30761	30766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_005362	A	6	6	30801	30806	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_005362	TAA	2	6	30853	30858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_005362	GCC	2	6	30859	30864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_005362	TAAT	2	8	30987	30994	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_005362	TAA	2	6	31000	31005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_005362	CTT	2	6	31027	31032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_005362	TTA	2	6	31098	31103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_005362	ATG	2	6	31186	31191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_005362	GAA	2	6	31200	31205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_005362	AGAT	2	8	32822	32829	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_005362	T	6	6	33667	33672	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_005362	AAT	3	9	33673	33681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_005362	TTTA	2	8	33682	33689	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_005362	GAT	2	6	33713	33718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_005362	AAT	2	6	33719	33724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_005362	TAA	2	6	33736	33741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_005362	TAA	2	6	33746	33751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_005362	ACA	2	6	33761	33766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_005362	ATT	2	6	33769	33774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_005362	TGC	2	6	35723	35728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_005362	AAT	2	6	35751	35756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_005362	ATT	2	6	35777	35782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_005362	TAG	2	6	35820	35825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_005362	ATATTT	2	12	35847	35858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_005362	T	6	6	35856	35861	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_005362	CGA	2	6	35869	35874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_005362	AT	3	6	35899	35904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_005362	T	6	6	35941	35946	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_005362	CTT	2	6	37318	37323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_005362	GTT	2	6	37334	37339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_005362	AGA	2	6	37359	37364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_005362	ATA	2	6	37376	37381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_005362	CTA	2	6	37397	37402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_005362	TAA	2	6	37420	37425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_005362	A	6	6	37487	37492	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_005362	ACT	2	6	37528	37533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_005362	TGGC	2	8	37668	37675	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
144	NC_005362	ATC	2	6	37699	37704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_005362	CAT	2	6	37786	37791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_005362	TTG	2	6	39596	39601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_005362	ATT	2	6	39626	39631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_005362	TAA	2	6	39633	39638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_005362	ATT	2	6	39652	39657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_005362	A	6	6	40542	40547	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_005362	T	6	6	40591	40596	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_005362	CT	3	6	40620	40625	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
153	NC_005362	TTC	2	6	40626	40631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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155	NC_005362	AAT	2	6	40661	40666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_005362	ATA	2	6	40679	40684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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159	NC_005362	A	7	7	42076	42082	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_005362	AAT	2	6	42099	42104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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163	NC_005362	T	6	6	43232	43237	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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165	NC_005362	TGA	2	6	44274	44279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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168	NC_005362	TTA	2	6	44340	44345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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171	NC_005362	AATC	2	8	44459	44466	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
172	NC_005362	AGGAA	2	10	44481	44490	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
173	NC_005362	AGG	2	6	44689	44694	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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185	NC_005362	AGA	2	6	49831	49836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
186	NC_005362	TCT	2	6	49848	49853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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188	NC_005362	TAA	2	6	50187	50192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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277	NC_005362	A	6	6	85883	85888	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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435	NC_005362	TAA	2	6	122841	122846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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439	NC_005362	AATT	2	8	124067	124074	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
440	NC_005362	GGA	2	6	124154	124159	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
441	NC_005362	GAA	2	6	125527	125532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
442	NC_005362	T	6	6	125553	125558	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
443	NC_005362	ATTA	2	8	125566	125573	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
444	NC_005362	A	7	7	125573	125579	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
445	NC_005362	TTA	2	6	125594	125599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
446	NC_005362	TAA	2	6	125616	125621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
447	NC_005362	GAATA	2	10	125658	125667	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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449	NC_005362	T	6	6	126471	126476	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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452	NC_005362	AGT	2	6	126607	126612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
453	NC_005362	AAT	2	6	126613	126618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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460	NC_005362	AGT	2	6	127316	127321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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462	NC_005362	ATTA	2	8	127435	127442	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
463	NC_005362	ATA	2	6	127450	127455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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470	NC_005362	AAT	2	6	132649	132654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
471	NC_005362	CTA	2	6	132673	132678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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484	NC_005362	A	6	6	141970	141975	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
485	NC_005362	GGA	2	6	141977	141982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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